Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms