Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms