Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms