Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LPIN3Q9BQK8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms