Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HINFPQ9BQA5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms