Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms