Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms