Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C9orf85Q96MD7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms