Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms