Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT1Q96EB6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms