Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPF3Q92784 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms