Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRUQ92729 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms