Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC12Q8WUD4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms