Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNIH3Q8TBE1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms