Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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LNX2Q8N448 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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LNX2Q8N448 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LNX2Q8N448 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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