Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNE4Q8N205 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms