Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRRC28Q86X40 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRC28Q86X40 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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