Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ATG4DQ86TL0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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