Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC141Q6ZP82 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms