Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM72Q6ZMU5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms