Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRIG3Q6UXM1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms