Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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