Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms