Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF220Q5VTB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms