Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGSNQ5TDP6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms