Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms