Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms