Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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