Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms