Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBPF1Q3BBV0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms