Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms