Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms