Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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GEN1Q17RS7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GEN1Q17RS7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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