Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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