Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms