Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms