Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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