Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPEGQ15772 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPEGQ15772 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms