Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms