Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SIX1Q15475 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SIX1Q15475 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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