Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RYR3Q15413 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms