Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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