Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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