Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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COL9A3Q14050 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COL9A3Q14050 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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