Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HTR4Q13639 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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