Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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