Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms