Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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