Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms