Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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